Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP17Q9ULZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP17Q9ULZ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms