Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP1R9AQ9ULJ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP1R9AQ9ULJ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP1R9AQ9ULJ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R9AQ9ULJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms