Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ZNF608Q9ULD9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
ZNF608Q9ULD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZNF608Q9ULD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms