Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC2LQ9UL33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms