Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB21Q9UL25 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB21Q9UL25 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB21Q9UL25 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB21Q9UL25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms