Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RARRES3Q9UL19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RARRES3Q9UL19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RARRES3Q9UL19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms