Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SARDHQ9UL12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms