Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAV3Q9UKW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAV3Q9UKW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms