Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A4Q9UKG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms