Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXL4Q9UKA2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXL4Q9UKA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXL4Q9UKA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL4Q9UKA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms