Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNOT7Q9UIV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNOT7Q9UIV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms