Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX20Q9UHI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX20Q9UHI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX20Q9UHI6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms