Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms