Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APEX2Q9UBZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms