Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTGFRNQ9P2B2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTGFRNQ9P2B2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGFRNQ9P2B2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms