Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTR3BQ9P1U1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms