Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9Q9P0T7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9Q9P0T7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9Q9P0T7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms