Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCMF1Q9P0J7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCMF1Q9P0J7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms