Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMCD1Q9NZU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMCD1Q9NZU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMCD1Q9NZU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms