Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH8Q9NYR8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms