Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC10Q9NYD6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC10Q9NYD6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms