Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX43Q9NXZ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX43Q9NXZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms