Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPD4Q9NXE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPD4Q9NXE4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPD4Q9NXE4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms