Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP3Q9NV31 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP3Q9NV31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms