Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCM2LQ9NUG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCM2LQ9NUG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms