Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT82Q9NSB4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT82Q9NSB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT82Q9NSB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT82Q9NSB4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms