Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCND1Q9NSA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCND1Q9NSA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms