Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDLIM7Q9NR12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDLIM7Q9NR12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM7Q9NR12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms