Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DMRT3Q9NQL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMRT3Q9NQL9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMRT3Q9NQL9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms