Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM9BQ9NQ34 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM9BQ9NQ34 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM9BQ9NQ34 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms