Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4BQ9NPR2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms