Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLMQ9NP87 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLMQ9NP87 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLMQ9NP87 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLMQ9NP87 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLMQ9NP87 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLMQ9NP87 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms