Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRDE2Q9H7Z3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms