Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUDS3Q9H7L9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUDS3Q9H7L9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUDS3Q9H7L9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms