Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD3Q9H7E2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD3Q9H7E2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD3Q9H7E2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms