Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABEP2Q9H5N1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP2Q9H5N1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP2Q9H5N1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP2Q9H5N1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RABEP2Q9H5N1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABEP2Q9H5N1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABEP2Q9H5N1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms