Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHD1Q9H4M9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 527.1 ms