Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCAD1Q9H4L7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms