Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NXF3Q9H4D5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NXF3Q9H4D5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXF3Q9H4D5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms