Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS11Q9H270 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS11Q9H270 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms