Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN3Q9H1Y3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OPN3Q9H1Y3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN3Q9H1Y3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms