Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPRTNQ9H040 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRTNQ9H040 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms