Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms