Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NYXQ9GZU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NYXQ9GZU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms