Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A8Q9C0K1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A8Q9C0K1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms