Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2OQ9C0C9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2OQ9C0C9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms