Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMBRA1Q9C0C7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMBRA1Q9C0C7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms