Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPEF2Q9C093 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPEF2Q9C093 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPEF2Q9C093 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms