Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM31Q9BZY9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM31Q9BZY9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms