Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms